炭疽芽孢杆菌的孢子进入人体后将被激活，细菌在体内大量繁殖，产生毒素，使人发病。常见进入人体的三种途径有：
1、皮肤暴露于这些污染物中，细菌会通过皮肤的微小伤口形成皮肤炭疽，表现为红斑或丘疹，形成水泡，坏死后形成黑色的结痂，即“皮肤炭疽”；
2、食用了被污染的肉类可以导致“肠炭疽”，出现高热、腹痛、腹泻、呕血、黑便等症状；
3、患病动物的皮毛、排泄物中含有炭疽芽孢杆菌，有可能形成气溶胶被吸入，则可能导致“肺炭疽”，早期症状类似于肺炎，继而发展为高热、呼吸局促、呼吸衰竭。
通常，95%的患者为“皮肤炭疽”，经过治疗大部分都可以痊愈，病死率小于1%，而最严重的是“肺炭疽”，病死率高达90%以上，“肠炭疽”病死率居中，治疗不及时或导致死亡。
还有一种不常见的炭疽感染是在北欧海洛因注射者中发现的，感染与“皮肤炭疽”类似，但感染深入皮肤深层或肌肉。
炭疽芽孢杆菌是一种革兰氏阳性细菌，可以采用对该菌的抗生素，如青霉素了类、头孢菌素类和氨基糖苷类等进行治疗，一般首选青霉素类药物。
感染者早期特异的症状不明显，可能在感染一天或者两个多月之间出现，感染晚期大量菌体繁殖，常规抗生素难以控制，蔓延全身，危及生命，因此患者应该早期隔离、尽早诊断、积极治疗。
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